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國道3號台南善化茄拔路段原規劃路線，係經考慮善化交流道區位及收費站利用台糖公司土地，以儘量減少建物拆遷原則研選。 但是茄拔社區居民認為距離聚落與當地信仰中心天后宮過近，噪音問題及空氣汙染恐影響生活品質及未來發展，因此，引起地方極大的反彈，要求路線東移遠離社區。

經過多次依民眾意見評估說明，居民仍無法接受原規劃路線，並強力阻止顧問公司人員進入社區進行鑽探及測量作業，社區主要道路口亦設置牌樓表達強烈反對路線。在最後一次協調會議中，時任臺南縣長陳唐山提議，路線的選擇改交由當地居民以投票方式決定。

當時公投法尚未成熟，投票的方式經縣府審慎的規劃與討論，最後決定就原規劃路線及東移距離天后宮約八百公尺之路線進行投票，茄拔社區內以戶為單位，每戶1票；兩條路線沿線土地，以地號為單位，每個地號1票。

投票結果出爐後，國工局認為公投法尚無法源依據，惟基於尊重地方治理原則，仍請縣府就其立場表達意見。在縣府依公投結果提出建議路線，並經國工局陳報交通部核定後，該路段的路線也就此而定，此路段也成為臺灣高速公路史上第一條，也是唯一一條，透過投票而調整路線的路段。